قبل 10 أعوام، عندما قاد العالم الشرير دكتور هيل (أبو الغضب) أتباعه في محاولة لتدمير كوكب الأرض والقضاء على البشر، فتصدى له مازنجر زد بقيادة البطل الشجاع كوجي (ماهر) ونجح في إحباط محاولاته وإعادة الأمن والسلام مجددًا إلى الأرض. فور انتهاء مهمته، عاد كوجي إلى حياته الطبيعة، تاركاً مازنجر زد، الآليّ العملاق، وراءه بعدما أدى مهمته، ومضى نحو تحقيق حلمه بأنّ يصبح عالمًا، متبعًا خطى والده وجده، وركز اهتمامه على إكمال دراسته الجامعية. إلى أنّ جاء ذلك اليوم الذي شنّ فيه الدكتور هيل هجومًا قويًا ومباغتًا على جبل فوجي، مهددًا بقاء واستمرار البشرية، لينهض كوجي بعزيمة عالية، ويعيد إقلاع مازنجر زد ويخوض حرب شرسة ضد قوى الشرّ.